海洋博公園の駐車場は全て無料です。
パーゴラの緑が暑い日ざしをやわらげてくれる緑陰の駐車場を含め、海洋博公園には全部で7ヶ所に駐車場（無料）を設けています。

駐車場の概要

駐車場 番号	駐車場名称	最寄り施設	駐車場台数
			普通 （身障者用）	大型	2輪
	南ゲート駐車場	熱帯・亜熱帯都市緑化植物園 バンコの森	82 （3）	6	0
	ポンプ場駐車場	海洋文化館 おきなわ郷土村 熱帯ドリームセンター	87	0	0
	中央ゲート駐車場		175 （3）	0	10
	中央ゲート北駐車場
	北ゲート前駐車場	沖縄美ら海水族館 オキちゃん劇場 エメラルドビーチ	70	0	0
	北駐車場（立体駐車場）		789 （9）	0	0
	東駐車場（バス専用）	-	0	66	0
臨時駐車場 （土・日・祝祭日のみ）		エメラルドビーチ	220